Le Centre de Ouagadougou a été créé en 1968. Ce qui est aujourd'hui l'Antenne IRD de Bobo-Dioulasso a été ouverte comme Mission Orstom dans les années cinquante. Cependant, bien avant l'ouverture du Centre et de la Mission, les chercheurs et techniciens de l'Office exerçaient des activités dans le pays sous forme de missions. L’IRD au Burkina Faso participe à la réalisation de programmes de recherche qui s’articulent autour de trois pôles : études du milieu physique et environnement, santé-nutrition et sciences sociales. Ses deux principaux partenaires sont l’université de Ouagadougou et le CNRST et ses instituts (Inera, IRSS, INSS, Irsat). En janvier 2005, 21 UR et US opéraient dans le pays, dont 11 avec des chercheurs affectés et 10 par des missions de longue durée ou de courte durée.

Pour plus d'informations, voir: http://burkina-faso.ird.fr/